Недавно я обновился до Ubuntu 18.04 и после отладки обнаружил, что пакет python -pymysql был каким-то образом удален автоматически (обновление действительно имело некоторые проблемы с неработающими зависимостями, которые пришлось решать вручную ). После
$ apt install python-pymysql
Трассировка снова работала.