Проблема с версией scons для cygwin64

for element in $(sed -n 'p;n' a.txt |sort -nk 1.9 |uniq |awk '{print $1}')
do
    echo $element; cat a.txt |grep -A1 $i |grep -v trans |grep -v \\\\--
done

Где.txt — ваш ввод. Проверено:

[root@megatron ~]# cat a.txt
transcr_25793 +
YAL039C -
transcr_25793 +
YAL037C-B -
transcr_20649 +
YBL100C -
transcr_7135 +
YBL029C-A -
transcr_11317 +
YBL067C -
transcr_25793 +
YAL038W +
transcr_7135 +
YBL029W +
[root@megatron ~]# for i in $(sed -n 'p;n' a.txt |sort -nk 1.9 |uniq |awk '{print $1}')
do
echo $i; cat a.txt |grep -A1 $i |grep -v trans |grep -v \\\\--
done
transcr_7135
YBL029C-A -
YBL029W +
transcr_11317
YBL067C -
transcr_20649
YBL100C -
transcr_25793
YAL039C -
YAL037C-B -
YAL038W +
[root@megatron ~]#