Может ли файл существовать без файловой системы?

Немного покопавшись, выяснилось, что на самом деле это объясняется на справочной странице(man jail.conf):

На самом деле вы не указываете, какие файлы (и )вы хотите использовать, они просто все обрабатываются в следующем порядке или приоритете:

• jail.conf
• jail.d/*.conf(все файлы в алфавитном порядке)
• jail.local
• jail.d/*.local(все файлы,в алфавитном порядке)

Все файлы считываются последовательно, и любой параметр, установленный в файле, переопределяет тот же параметр (, тот же раздел, то же имя ), что и в предыдущих файлах.

В вашем случае файлы будут обрабатываться в следующем порядке:

• jail.conf
• jail.d/defaults-debian.conf
• jail.d/jail-debian.conf

Имя последнего файла не обязательно должно быть jail-debian.conf. На самом деле это может быть что угодно, главное, чтобы оно заканчивалось на .confили .localи шло после defaults-debian.confв алфавитном порядке.