Я нашел решение из https://www.makeuseof.com/tag/refresh-linux-desktop-without-rebooting/. Просто откройте терминал и запустите командыxfce4-panel -r && xfwm4 --replace
из комментариев @Uncle Billy и @waltinator:
Для поиска каталоги должны быть исполняемыми.
Поэтому измените разрешения соответствующих каталогов с помощьюchmod +x <folder>