Настройте iPython для запуска последней версии Python

Предполагая, что XML правильно сформирован, следующее удалит строку /test/src/repos/emp.deploy/из значений каждого узла File, содержащего эту строку, и строку .idtс помощью XMLStarlet (или, скорее, оставит бит значения, следующего за путем):

xmlstarlet ed -u '//File[contains(., "/test/src/repos/emp.deploy/") and contains(., ".idt")]' \
              -x 'substring-after(., "/test/src/repos/emp.deploy/")' file.xml

Добавление узла rootв ваш пример документа и выполнение приведенной выше команды генерирует

<?xml version="1.0"?>
<root>
  <Application Name="empBnf" ServiceType="SOAP" BitMode="32" Path="/test/bin"/>
  <FileList>
    <File>emptest1.idt</File>
    <File>emptest2.idt</File>
    <File>emptest3.idt
     </File>
    <File>/test/src/repos/emp.deploy/emptest.wsdl</File>
  </FileList>
  <Service Qualifier="http://www.mytest.com/test/empbnf" Name="/test/src/repos/empBnf" XManagement="Container">
    <Operation>Operation</Operation>
  </Service>
</root>

Было бы еще лучше, если бы работало следующее:

xmlstrlet ed -u '//File[contains(., ".idt")]' \
             -x 'replace(.,".*/","")' file.xml

... но XMLStarlet (в моей системе ), похоже, не хочет знать о функции replace().