хочу проверить, присутствует ли элемент массива в первой строке файла

В таких случаях почти никогда не приходится считать. Поменяв местами петли whileи for, мы можем сделать следующее, которое вы можете изменить в соответствии с потребностями.

for el in "${MYARRAY[@]}"
do
  if IFS= read -r line < keyans.txt
  then
    case $line in
      *"$el"*) echo Present ;;
            *) echo Not present
    esac
  else
    break
  fi
done