Каталог SFTP, принадлежащий пользователю

Предполагаю, что вы полагаетесь на какое-то имя udev, которого нет в initramfs. т.е. зашифрованный раздел расшифровывается, но не связывается с /dev/aether/core.

Я бы рекомендовал попробовать указать корневой раздел по UUID или имени или использовать имя устройства, которое вы использовали для chroot.

Все это при условии, что вы не используете LVM поверх шифрования.