В чем разница между `\b `и `\S `в PCRE grep?

xargsберет свои входные данные и превращает их в аргументы данной команды. grepвозвращает интересующую вас строку, а xargsдобавляет эту строку в качестве аргумента к команде sed, которая вместо этого ожидает имя файла. Вам вообще не нужен xargs.

Вы можете указать sedдействовать только на той строке, которая соответствует шаблону:

sed -i~ -e '/(MCLK)/{s/\t//g' -e 's/(MCLK)//g}' ~/test.txt