Ядро кэширует только те данные, к которым был осуществлен доступ. Если вы не прочитали с диска более 1 ГБ данных с момента последней загрузки, то он не будет кэшировать более 1 ГБ.
Выдержка из сообщения об ошибке. Похоже, это соответствующая часть.
dpkg: dependency problems prevent configuration of kali-desktop-core:
kali-desktop-core depends on kali-menu; however:
Package kali-menu is not configured yet.