Выход из-за фатальной ошибки после команды конфигурации openvpn --

Вы можете использовать sedдля получения только чисел и pasteдля объединения строк с ,в качестве разделителя:

sed -E 's/^H([0-9]*).*$/\1/' file | paste -sd,

или grepиpaste:

grep -Po '^H\K[0-9]*' file | paste -sd,
grep -o '^H[0-9]*' file |  cut -c 2- | paste -sd,

Вы можете заменить разрыв строки с ,на sed, но imo pasteпроще.