как использовать камеру ipu3 -cio в Linux

Это очень легко сделать с помощьюawk:

$ awk 'NR==FNR{a[$1]=$2; next}{$1=a[$1]; print}' file2 file1
GCF_000014165.1_ASM1416v1_protein.faa WP_011558474.1 1155234 1156286 44173
GCF_000014165.1_ASM1416v1_protein.faa WP_011558475.1 1156298 1156807 12
GCF_000014165.1_ASM1416v1_protein.faa WP_011558476.1 1156804 1157820 -3
GCF_000015405.1_ASM1540v1_protein.faa WP_011558474.1 1159543 1160595 42748
GCF_000015405.1_ASM1540v1_protein.faa WP_011558475.1 1160607 1161116 12
GCF_000015405.1_ASM1540v1_protein.faa WP_011558476.1 1161113 1162129 -3
GCF_000016005.1_ASM1600v1_protein.faa WP_011559727.1 2481079 2481633 8
GCF_000016005.1_ASM1600v1_protein.faa WP_011854835.1 1163068 1164120 42559
GCF_000016005.1_ASM1600v1_protein.faa WP_011854836.1 1164127 1164636 7

Или, поскольку это выглядит как вкладка -разделенного файла:

$ awk -vOFS="\t" 'NR==FNR{a[$1]=$2; next}{$1=a[$1]; print}' file2 file1
GCF_000014165.1_ASM1416v1_protein.faa   WP_011558474.1  1155234 1156286 44173
GCF_000014165.1_ASM1416v1_protein.faa   WP_011558475.1  1156298 1156807 12
GCF_000014165.1_ASM1416v1_protein.faa   WP_011558476.1  1156804 1157820 -3
GCF_000015405.1_ASM1540v1_protein.faa   WP_011558474.1  1159543 1160595 42748
GCF_000015405.1_ASM1540v1_protein.faa   WP_011558475.1  1160607 1161116 12
GCF_000015405.1_ASM1540v1_protein.faa   WP_011558476.1  1161113 1162129 -3
GCF_000016005.1_ASM1600v1_protein.faa   WP_011559727.1  2481079 2481633 8
GCF_000016005.1_ASM1600v1_protein.faa   WP_011854835.1  1163068 1164120 42559
GCF_000016005.1_ASM1600v1_protein.faa   WP_011854836.1  1164127 1164636 7

Это предполагает, что каждый идентификатор RefSeq(NC_*)в file1имеет соответствующую запись в file2.

Пояснение

• NR==FNR:NR — номер текущей строки, FNR — номер строки текущего файла. Они будут идентичными только во время чтения первого файла (, здесь file2).
• a[$1]=$2; next:если это первый файл (см. выше ), сохранить 2-е поле в массиве, ключом которого является 1-е поле. Затем перейдите к строке next. Это гарантирует, что следующий блок не будет выполнен для первого файла.
• {$1=a[$1]; print}:теперь, во втором файле, установите 1-е поле на любое значение, которое было сохранено в массиве aдля 1-го поля (, поэтому,связанное значение изfile2)и напечатайте результирующую строку.