данные в файле fastq, используйте gnu sed на 4 на 4 строки,
$ sed -nE ' N;N;N;s/(.+\.1)(\s.+\n)(.{6})(\w+)\s*(\n.+\.1)(.+\n).{6}(\w+)/\1.\3\2\4\5.\3\6\7/p' fastq
@SRR5394526.1.CGATGT 1 length=150
TAAATCAACGATAACTACACCG
+SRR5394526.1.CGATGT 1 length=150
FJJJJJJJJJJAJJJJJJJJJF
Узнайте, как настроить обратные прокси. То, что вы хотите сделать, почти то же самое, но работает с локального хоста, а не с другой машины.