Каков наилучший подход к дублированию файла с другим именем файла и изменению содержимого в Unix?

Просто cp не может создать несколько файлов за одно выполнение.

Хотя это и не очень элегантно, вы можете использовать следующий цикл для достижения своей цели:

for file in *.csv;do for end in _H _D _T ;do pc $file ${file%.csv}$end;done;rm $file;done

Который в основном просто перебирает все ваши CSV-файлы, создает три копии и удаляет оригинал.