Сделайте резервную копию на случай, если она понадобится в будущем:
cp /run/log/journal/<temp-string>/system.journal /mylog/dir/back/system.journal.bak
Очистить файл:
cd /run/log/journal/<temp-string>/
>system.journal
Отметьте для просмотра последних журналов:
journalctl -xe