Похоже, вы хотите соединить статический список номеров портов с именами серверов, полученными из команды.

Вместо этого сделайте это:

PATH=$MQ_INSTALL_PATH/bin:$PATH

ports=( 60720 60721 60722 60723 60724 )
i=0

dspmq | sed -n '/QMNAME/{ s/.*(\([^)]*\)).*/\1/p; }' |
while read -r server && [ "$i" -lt "${#ports[@]}" ]; do
    printf 'Port on %s is %d\n' "$server" "${ports[i]}"
    i=$(( i+1 ))
done

По сути, это то, что вы пытались сделать, но использовали два вложенных цикла, а не один цикл с комбинированным условием. Код также считывает имена серверов непосредственно из конвейера команд, который создает их, не сохраняя их в промежуточном массиве.

Если вы хотите передать номера портов в обратном порядке, используйте

PATH=$MQ_INSTALL_PATH/bin:$PATH

ports=( 60720 60721 60722 60723 60724 )
i=${#ports[@]}

dspmq | sed -n '/QMNAME/{ s/.*(\([^)]*\)).*/\1/p; }' |
while read -r server && [ "$i" -gt 0 ]; do
    i=$(( i-1 ))
    printf 'Port on %s is %d\n' "$server" "${ports[i]}"
done

Выражение ${#ports[@]}во всех приведенных выше случаях расширяется до количества элементов в массиве ports.

Команда sed

sed -n '/QMNAME/{ s/.*(\([^)]*\)).*/\1/p; }'

извлечет строку в первой скобке из строк, содержащих строку QMNAME. Можно также написать

sed -n '/QMNAME/{ s/.*(//; s/).*//p; }'