Работа одного клиента Rsync занимает более 10 часов

Вы можете сделать это с помощью POSIX sed, как описано здесь. Обратите внимание, что это решение применимо к обоим типам показанных вами входных данных. Ограничения: ввод не является многострочным, так как мы используем новые строки в качестве маркеров для эффекта. требуется трансформация.

$ sed -e '
      :top
      /\[\/quote]/!b
      s//\
&/
      s/\[quote=/\
\
&/

     :loop
        s/\(\n\n\)\(\[quote=.*\)\(\[quote=.*\n\)/\2\1\3/
     tloop

     s/\n\n.*\n\[\/quote]//
     btop
 '  input.txt