Или попробуйтеawk
awk -F"[.]" 'NR==FNR {SRCH[$1]; next} $1 in SRCH' file2 file1
sysserver0015 btesxid433.eu.domain.com
i3 теперь просматривает ~/.config/i3/config
перед ~/.i3/config
, поэтому, если первое существует, второе будет игнорироваться.
Одно из возможных исправлений — заменить ~/.config/i3/config
символической ссылкой на ~/.i3/config
или переместить последнюю на ~/.config/i3/config
.