Безопасно ли удалять случайную копию корневой папки?

Кажется, это помогает:

$ printf "\t"; find input? | xargs printf "%s\t"; echo "";  paste input? | awk 'BEGIN { OFS="\t" } {printf "%s%s", $1,OFS; for( i=2;i<=NF;i++) { if( $1 != $i ) { printf "%s%s", $i, OFS } } printf "\n" }'
    input1  input2  input3
p1_61_length_503_cov_4.457447   24  24  24
p1_62_length_500_cov_4.037534   35  35  35
p1_63_length_500_cov_1.718499   6   6   6
p5_1_length_5181_cov_48.147804  0   0   0
p5_2_length_4872_cov_28.387777  0   0   0
p5_4_length_4057_cov_39.930534  0   0   0

Столбцы здесь разделены табуляцией -для удобства обработки; выровнять столбцы по вертикали здесь относительно тривиально.

Собственно awkскрипт:

BEGIN { 
   OFS="\t" 
} 

{
   printf "%s%s", $1,OFS;
   for( i=2;i<=NF;i++) { 
      if( $1 != $i ) { 
         printf "%s%s", $i, OFS
      }
    } 
    printf "\n"
}