В итоге Suse признала это ошибкой и с тех пор в конце 2017 года внедрила исправление в стабильное ядро. Мы успешно применили его к нашей среде, и с тех пор проблема не возникала.
В одну сторону (, если порядок вывода не имеет значения):
awk -F= '{a[$1]+=$2;}END{for(i in a){print i "=" a[i]}}' file
Считайте файл в массив с 1-м столбцом в качестве индекса, а значение добавляется со значением 2-го столбца. После анализа файла просто распечатайте записи массива.
Обновлено (, так как новый файл имеет пробел в качестве разделителя):
awk '{a[$1]+=$2;}END{for(i in a){print i " " a[i]}}' file