Как добавить общую библиотеку в configure?

Использование joinи оболочки, которая понимает подстановки процессов:

$ join -t ' ' -1 2 -2 3 -o2.1,0,1.3,1.4,1.5,1.6 <( sort -k2 file1 ) <( tr ',' ' ' <file2 | sort -k3 )
1 rs3094315 0 0 C T

Второй файл, file2, имеет проблему, заключающуюся в том, что он использует разделитель полей, отличный от первого файла, file1. Это можно исправить, пропустив его содержимое через trи заменив все запятые пробелами.

Затем два файла сортируются по полям, данные по которым мы собираемся объединить; поле 2 в первом файле и поле 3 во втором файле.

Затем joinпрочитает эти два набора данных и соединит их в полях, разделенных указанными пробелами -.

Поля вывода определяются флагом -o, и мы выбираем первое поле второго файла, поле соединения, за которым следуют поля с 3 по 6 из первого файла.