systemd ничего не останавливает. Ваш демон завершает работу , а systemd очищает то, что вы сказали, что это вспомогательные остаточные процессы.

Частично это связано с тем, что вы не используете его так, как указано в документе VPP, а именно наличие nodaemonв файле конфигурации и для использованияType=simple.

И вы дали людям только частичную трассировку стека, без символов, для работы с более ранним(не "через некоторое время"; прочитайте временные метки )прямой крах вашего демона. Нет никакой надежды, что не -ясновидящие мира смогут это отладить.

Can any one help me out ?

Так что, строго говоря, ответ на этот да -нет вопрос будет "Нет".

Дополнительная литература

• https://unix.stackexchange.com/a/200365/5132