Как остановить сообщения PAM в auth.log для определенного сценария, запускаемого с помощью sudo?

Проблема в том, что вы путаете ввод и вывод:

exec 3>&${test[0]}
exec 4>&${test[1]}
input <&3 &>4 &

Вы открываете &3и &4только для записи. Но первый может только читать. Чтение из &3завершается неудачно, потому что вы открыли fd только для записи. Вам нужно

exec 3<&${test[0]}