сортировка по каналу не работает

cut -d':' -f3извлечет третье:-поле с разделителями из строки, но строка, к которой вы его применяете, выглядит как

Mem usage : 4960216kb

т. е. имеет только два поля:

1. Mem usage и
2.  4960216kb.

Чтобы избежать этого длинного -извилистого конвейера, вы можете вместо этого использовать

sed -n '/^Mem/s/[^[:digit:]]*//gp' *-racon-2.fasta.o* | sort -n

При этом используется один вызов sedдля извлечения строк, начинающихся со строки Mem, и вырезается число, удаляя все, что не является цифрой в этих строках. Затем он передает извлеченные числа в sort -nдля числовой сортировки.

Это было бы эквивалентно

grep '^Mem' *-racon-2.fasta.o* | tr -d -c '[:digit:]\n' | sort -n

awk -F ":" '/^Mem usage/{gsub(/[a-z ]/,"",$NF);print $NF}' p.txt|awk 'BEGIN{sum=0}($1 > sum){sum=$1}END{print sum}'


tested and worked fine