bash-скрипт для поиска результатов из нескольких входных файлов, использующих samtools, в новый выходной CSV-файл

Регулярные выражения жадны. Они будут соответствовать первому, что они могут. (|a|b)всегда будет соответствовать нулевой строке.

Точно так же (\d{7}|\d{7}-\d{7})всегда будет соответствовать только\d{7}(или не будет соответствовать вообще ). Он никогда не перейдет ко второму варианту.

Вместо этого вы хотите (\d{7}-\d{7}|\d{7}). Но зачем так многословно?

\d{7}(-\d{7})?будет работать так же хорошо.

Таким образом, вы получаете:

Range_\d{7}(-\d{7})?