поиск того, что находится в файле 1 в файле 2 и выходной столбец файла 2

Самый простой способ — использовать grepдля сопоставления с образцом, а затем awkдля извлечения второго поля.

grep -f File1 File2 | awk '{print $2}'

Если File1 содержит фиксированные -строки, а не шаблоны регулярных выражений, используйте параметр grep -F, также известный как --fixed-strings:

grep -F -f File1 File2 | awk '{print $2}'

Если поля (столбцы )в файле 2 разделены табуляцией,

grep -f File1 File2 | cut -f2

иначе,

grep -f File1 File2 | awk '{print $2}'

Или, полностью в awk (и независимо от вкуса пробела):

awk '!flag { a[$1]++ } flag { if (a[$1]) print $2 }' File1 flag=2 File2