Если вы устанавливаете GNU Parallel , вы можете сделать это параллельно следующим образом:
parallel./transeq {} {}.faa -table 11 ::: xyz*
Если ваша программа интенсивно использует ЦП, она должна немного ускориться.
Да, см.:https://askubuntu.com/questions/109413/how-do-i-use-overlayfs
В двух словах, вы должны смонтировать /
где-то еще или привязать монтирование там, прежде чем монтировать оверлеи.