prlimit вызывает ошибку «Слишком длинный список аргументов» с некоторыми ограничениями ресурсов

Примерно так должно работать:

while IFS= read -r dir
do
    cp -f "$dir"/* target
done < list

где list— список каталогов а target— это каталог, в который вы хотите скопировать файлы. Файлы в каталогах, которые появляются позже в списке перезапишет файлы в каталогах, которые появляются раньше в списке — cp -fопределяет опцию «принудительной перезаписи» для программы копирования. Это предполагает:

• Имена каталогов не содержат символов новой строки. (В противном случае их нельзя было бы перечислить в простом текстовом файле.)
• Файл списка фактически не содержит кавычек.
• В каждом каталоге есть только (обычные )файлы, не подкаталоги или специальные вещи.
• Имена файлов не начинаются с..