prename
enfoque:
prename -n 's/^([^_]+)_.*_([^_]+)_[0-9]+\./1$1.$2./' *.fastq
(-n
-ninguna acción ; mostrar qué archivos habrían sido renombrados)
Использование GNU sed:
$ sed -e '6!RFile 2' -e '7RFile 2' File\ 1
1
a
2
b
3
c
4
d
5
e
6
7
f
g
8
h
9
i
10
j
11
$ awk 'NR==FNR{Arr[NR]=$0;next}{print;if(Arr[FNR]){print Arr[FNR]}}' file2 file1
1
a
2
b
3
c
4
d
5
6
прочитать файл2 и сохранить значения в массиве, затем начать чтение файла1 и распечатать вместе со значениями файла2