собрать и создать матрицу, разделенную табуляцией

У меня есть 6 текстовых файлов (каждый соответствует определенному образцу), и каждый файл выглядит так:

Gene_ID Gene_Name   Strand  Start   End Length  Coverage    FPKM    TPM
ENSMUSG00000102735  Gm7369  +   4610471 4611406 936 0   0   0
ENSMUSG00000025900  Rp1 -   4290846 4409241 10926   0   0   0
ENSMUSG00000104123  Gm37483 -   4363346 4364829 1484    0   0   0
ENSMUSG00000102175  Gm6119  -   4692219 4693424 1206    0.328358    0.015815    0.008621

Я хочу собрать все элементы из 1 и 2 столбца в один файл и соответствующие tpm значения (9-й столбец) для каждого образца в новом файле, поэтому, если значение tpm отсутствует, введите 0.

Мой выходной файл должен выглядеть следующим образом:

gene_id gene_name sample1_tpm sample2_tpm sample3_tpm ......sample6_tpm
-1
31.03.2016, 07:41
0 ответов

Теги

Похожие вопросы