Некоторые подробности о форматировании ваших данных будут полезны. Без каких-либо подробностей нам придется сделать некоторые предположения:
- SNP перечислены по одному в строке в каком-то файле
- ваши строки данных разделены пробелами -
- SNP, появляющийся в любом месте строки, считается совпадением в этой строке
- нам нужны столбцы 1, 2 и 3 из каждой совпадающей строки
В таком случае попробуйте это:
grep -f list_of_SNPs.txt very_large.txt | cut -f 1,2,3 > new_file.txt
1
Oh My Goodness
28.01.2020, 04:29
Ссылка