добавить табуляцию в определенные столбцы
У меня есть следующие данные, они разделены табуляцией, но я обнаружил, что некоторые столбцы - нет. Как убедиться, что все данные разделены табуляцией?
вот часть данных:
rs987435 C G 1 1 2 1 20
rs345783 C G 1 1 1 1 01
rs955894 G T 2 2 2 2 22
rs6088791 A G 1 0 1 0 22
rs11180435 C T 1 1 1 1 10
rs17571465 A T 2 2 2 2 22
rs17011450 C T 2 2 1 2 22
rs6919430 A C 2 2 2 2 22
rs2342723 C T 0 0 0 0 01
rs11992567 C T 2 2 2 2 22
Столбцы, начинающиеся с 4-го столбца, должны быть только 0,1,2; как видите, 8-го столбца нет. Мне нужно добавить табуляцию между этими числами, как я могу это сделать в Linux?
0
Jeff Schaller
12.12.2016, 03:13
Ссылка
2 ответа
Поскольку вы используете Linux, у вас будет GNU Sed (в отличие от BSD Sed), поэтому вы можете просто сделать:
sed 's/.$/\t&/' file.txt
Когда вы будете удовлетворены выводом, который вы видите в командной строке, сделайте это «на месте» (т.е. сохранить его обратно в файл) с флагом -i :
sed -i 's/.$/\t&/' file.txt
Это означает вставку символа табуляции перед последним символом в каждой строке.
2
Wildcard
28.01.2020, 02:47
Ссылка