Почему логические тома используются с разделами LUKS?

Что Вы называете, “стандартные” разделы являются разделами IBM PC. Точка использования их должна быть совместима с другими операционными системами, которые как или даже требуют разделов IBM PC.

В программном обеспечении Linux объем RAID, или в зашифрованном томе LUKS, только уходы Linux. Таким образом, Вы могли бы также использовать собственное разделение Linux системы, т.е. LVM, который намного более мощен (имена, а не числа, непоследовательные разделы, зеркальное отражение, снимки, группы объема, …).

С тех пор редко существует любая точка наличия разделов стиля ПК в объемах LUKS, сценарии распределения обычно не настраиваются для обработки того случая.