Как удалить строки в текстовом файле, содержащие три дублирующих поля (строки, разделенные пробелами)

Двойные кавычки в вашем случае являются проблемой в скрипте expect.

spawn sh -c "ssh IPaddress "./bin/show_info.py |.. sed 's/total.*//g'" > Report_2017.txt"

Просто обратите внимание, что из-за двойных кавычек, оканчивающихся после IP-адреса, канал остается открытым.

Вы можете попробовать это:

spawn sh -c "ssh IPaddress \"./bin/show_info.py |.. sed 's/total.*//g'\" > Report_2017.txt"