запуск pm2 из удаленного сценария оболочки

Если то, что вы запускаете во внутреннем цикле, занимает некоторое количество времени (echo очень быстро запускается), то, когда циклы запустили все асинхронные процессы, они будут работать одновременно.

Сами петли не являются «параллельными».