echo $JAVA_HOME
Будет напечатано значение, если оно установлено. Однако, если вы не установили его вручную в своих сценариях запуска, он, вероятно, не установлен. Вот почему он пуст.
Вы можете настроить его с помощью (или аналогичного)
export JAVA_HOME=/home/user/jdk1.7.0_02/
У меня была такая же проблема с Handbrake 0.10.5, но текущая версия на github работает отлично.
git clone https://github.com/HandBrake/HandBrake.git
cd HandBrake
./configure --enable-x265 --enable-fdk-aac --enable-libav-aac
cd build
make
sudo make install