Вы можете легко иметь несколько установок java и выбирать одну для использования: С помощью механизма /etc/alternatives/:
# /usr/sbin/update-alternatives --config java
И: Libreoffice без проблем использует Oracle java.
Да. Большинство защищенных USB-устройств получают питание и расшифровываются без подключения к сети.