Если вам нужна визуальная подсказка, я написал простое расширение GNOME Shell, которое показывает значок, который сообщает вам, используете ли вы Wayland или Xorg
http://www.fepede.net / блог / 2017/04 / gnome_shell_extension_xorwayland /
Просто для полноты картины :оказалось, что это была просто ошибка, которую исправили после пары обновлений из репозитория.
У меня такая же проблема. Кажется, проблема связана с системой расширений, возможно, когда я запускаю Chromium с отключенными расширениями, он открывается правильно:
chromium-browser --disable-extensions
Надеюсь, это скоро будет исправлено, а пока вы сможете использовать Chromium по своему усмотрению.