Слияние нескольких файлов на основе md5sum

Короткий ответ: вы не можете этого сделать. На самом деле, bash не может этого сделать, хотя вы, человек, можете это сделать. Подробнее см. https://stackoverflow.com/questions/11541568/how-to-do-float-comparison-in-bash.