В настоящее время вы сортируете всю строку, но похоже, что вы хотите сортировать только первый столбец. В том виде, в котором ваша команда написана сейчас, столбцы будут в основном сгруппированы вместе, например:
Cyb5 157.426 -> Cyb5157426
Cyb561 0.425933 -> Cyb5610425933
vs
Cyb561 7.11003 -> Cyb561711003
Cyb5 64.074 -> Cyb564074
Чтобы отсортировать только первый столбец, вам нужно использовать следующую команду:
sort -d -k1,1