Используйте IFS, который определяет разделитель полей.
SAVEIFS=$IFS
IFS=$(echo -en "\n\b")
prev_dir=/cygdrive/c/Users/abhisek.samanta/Desktop/New_folder
new_dir=/cygdrive/c/Users/abhisek.samanta/Desktop/New
cd $prev_dir
for i in `cat req_files.txt`
do
mv $prev_dir/$i $new_dir/
done
IFS=$SAVEIFS