Почему XInput не может работать в X-терминале?

Используйте sed :

sed -i.bak '\|^\. /myfolder/lib\.sh| {
    r /myfolder/lib.sh
    d
}' script.sh

Этот сценарий делает следующее:

• \ | ^ \. / myfolder / lib \ .sh | {...} => найдите строки, начинающиеся с . /myfolder/lib.sh и выполните команды внутри фигурных скобок
• r /myfolder/lib.sh => выведите содержимое /myfolder/lib.sh
• d => удалите строку (. /myfolder/lib.sh)

Остальные строки, конечно же, оставим как есть.