Можно также следовать инструкциям здесь для отключения этого поведения в целом:
http://wiki.winehq.org/FAQ#head-c847a3ded88bac0e61aae0037fa7dbd4c7ae042a
Хотя необходимо будет все еще выполнить шаги в ответе nozimica для избавлений от существующих ассоциаций.
cd /usr/ports/java/openjdk6
make config ( off FASTDEBUG )
make install clean