Можно использовать перфект для доступа к аппаратным счетчикам производительности:
$ perf stat -e dTLB-load-misses,iTLB-load-misses /path/to/command
например:
$ perf stat -e dTLB-load-misses,iTLB-load-misses /bin/ls > /dev/null
Performance counter stats for '/bin/ls':
5,775 dTLB-load-misses
1,059 iTLB-load-misses
0.001897682 seconds time elapsed
Лучше отключите это и просто закройте пользователей (или даже просто каждого пользователя) при перемещении данных. Если у Вас будут люди, входящие в систему, то они изменят данные, которые будут скопированы, и затем необходимо было бы перезапустить копию. Промывка и повторение, пока у Вас нет всего этого. Затем переключитесь, но Вы не можете сделать этого, в то время как они зарегистрированы. И так далее. Сглаживать ошибки в любой такой схеме - большая работа, и если это - просто временная мера, забудьте об этом. Слишком много работы, слишком много риска.