Используйте пакет remrunner для python. Он копирует локальные сценарии в удаленный компьютер, а затем выполняет их.
pip install remrunner
python
>> from rumrunner import runner
>> r = runner.Runner(REMOTE_HOST_IPADDR, REMOTE_HOST_USER)
>> rval, stdout, stderr = r.run('/path/to/local/script.py')
>> if rval:
print stderr
else:
print stdout