Существует ли альтернатива fail2ban в официальном репозитории Centos?

debdiff - это инструмент, а не формат файла, и одна из вещей, которую он может произвести - это патч. Так что да, команда для применения файла в #845173 просто

patch -p1 < debdelta_0.55+nmu1.debdiff

Вы, вероятно, также найдете файлы с расширениями .nmudiff в ваших исследованиях ошибок с патчами; это также простые патчи и применяются таким же образом.