Вы можете использовать следующую конструкцию, предполагая, что MAC-адреса нормализованы, т.е. оба файла используют уникальный разделитель, например двоеточие или тире:
$ grep -Ff file-with-prefixes file-with-machine-mac-addresses
Это может или не может соответствовать вашей семантике «расслабленного» пересечения.
/ Обновлено для использования grep -F на основе комментария @ wildcard.