Звук загадочно пропал на рабочем столе Debian - как его вернуть?

Основная структура условий следующая:

if [ condition ]; then
    dosomething
fi

С else:

if [ condition ]; then
    dosomething
elif [ condition ]; then
    dootherthing
else
    thelastchancetodosomething
fi

Кроме того, я думаю, что это условие в вашем коде неверно:

if [ $package == *".tar.gz" ]; then
    tar -zxvf folder.tar.gz
fi

Если я правильно понимаю, это должно быть что-то вроде:

if echo $package | grep -qF ".tar.gz"; then
    tar -zxvf $package
fi

О, и используйте # для комментариев вместо // .

Исправление вашего примера и улучшение отступа, чтобы сделать его более четким:

if [ choice = "1" ]; then
    if echo $package | grep -qF ".tar.gz"; then
        tar -zxvf $package
    # You need to close previous `if` with a `fi` you want to use another
    # `if` here below, but we can use `elif`, so we don't need to close it.
    elif echo $package | grep -qF ".tar.bz2"; then
        tar -xvfj $package
    fi
    cd ${package%.*.*} # this removes the .tar.* extension
    ./configure
    make 
    make install
elif [ choice = "2" ]; then
    dpkg -i $package
fi