Сначала я бы попробовал следующее:
chattr -i [directory]
chattr -a [directory]
chattr
изменяет атрибуты файла (и каталога) в файловой системе Linux
chattr +[option] adds an attribute
chattr -[option] removes and attribute
Флаг только добавления 'a'
предотвращает удаление каталога и любых файлов или каталогов, созданных в нем.
Элемент с атрибутом 'i'
не может быть изменен: его нельзя удалить или переименовать.