Команда sed - Заменить строку в файле

Я думаю, ваша основная проблема в том, что вы пытались использовать синтаксис bash в сценарии sh. Bash определяет расширения для общего знаменателя sh; если вы хотите использовать специфические для bash функции, ваш сценарий должен начинаться с #!/bin/bash, а не с #!/bin/sh. В

Sh нет синтаксиса ((...)) для арифметических выражений. Но он здесь и не нужен, вы можете использовать переносимый [ ... ] условный синтаксис. В условном [ ... ] оператор "меньше чем" записывается -lt.

Скобки {1..2} - еще одна особенность bash, которой нет в sh. Еще одна ошибка в вашем скрипте - X=$A+1, который устанавливает X в строку вида 42+1, если значение A равно 42; чтобы выполнить арифметическое вычисление, нужно использовать синтаксис арифметического выражения $((...)).

Также, в качестве общего замечания, всегда используйте двойные кавычки вокруг подстановок переменных.

Еще одна проблема с вашим кодом заключается в том, что он выглядит так, будто A - десятичное число. Арифметика Shell работает только с целыми числами. Я адаптировал алгоритм, но проверьте, что он делает, возможно, я округлил не так, как вы задумали. Использовать awk только для подсчета количества строк - излишество, wc -l - более понятный и быстрый способ сделать это. Аналогично, чтобы вывести первые N строк файла, просто вызовите head.

Еще одна ошибка заключается в том, что $i_chunk - это значение переменной i_chunk. Чтобы взять значение i и добавить _chunk, нужно разделить имя переменной скобками: ${i}_chunk.

Я понятия не имею, что должен делать цикл на j, я оставил его в покое.

#!/bin/sh
for i in 1 2
do
  input="../ExpressionSet_${i}_chunk.txt"
  for j in 1 2
  do
    A=$(wc -l <"$input")
    Y=100
    X=0
    if [ "$A" -lt "$Y" ]; then
      X=$((A+100))
    else
      X=$A
    fi
    head -n "$((X/100))" "$input" > "$i"_top1pc.txt
    head -n "$((X/20))" "$input" > "$i"_top5pc.txt
  done
done

Если вы решите написать сценарий на bash, вы можете использовать несколько возможностей bash:

• ((...)) для арифметических оценок (но все еще только целочисленных)
• typeset -i для объявления целочисленной переменной, так что присвоение арифметического выражения оценивает ее

#!/bin/bash
for i in 1 2
do
  input="../ExpressionSet_${i}_chunk.txt"
  for j in 1 2
  do
    A=$(wc -l <"$input")
    Y=100
    typeset -i X
    if ((A < Y)); then
      X=A+100
    else
      X=$A
    fi
    head -n "$((X/100))" "$input" > "$i"_top1pc.txt
    head -n "$((X/20))" "$input" > "$i"_top5pc.txt
  done
done