Организация трехмерных данных с помощью awk / sed / perl
Вам необходимо перевести Chromebook в режим разработчика , чтобы команда оболочки заработала. Это предварительное условие для установки crouton , которое задокументировано в первой строке предварительного раздела руководства, которому вы следуете.
Как вы это сделаете, будет зависеть от вашего конкретного устройства; есть много гидов.
3
Jeff Schaller
25.05.2016, 22:21
Ссылка
2 ответа
На perl:
#!/usr/bin/perl
my (%hotu, %hpc)=();
while(<>){
my($pc,$otu,$v)=split;
$hpc{$pc}=1;
($hotu{$otu} or $hotu{$otu}={})->{$pc}+=$v;
}
#headers
my @apc = sort keys %hpc;
print join ("\t", 'OTU_ID', @apc) . "\n";
#values
foreach my $otu (sort keys %hotu) {
print join ("\t", $otu, map {$_=0 unless defined; $_} @{$hotu{$otu}}{@apc}) . "\n";
}
4
Ezequiel Tolnay
27.01.2020, 21:12
Ссылка
В awk :
{ data[$2, $1] = $3; }
END {
split("OTU0 OTU1 OTU2 OTU3", rows);
split("OTU_ID PC.354 PC.355 PC.356", cols);
for (i = 1; i <= 4; i++) {
printf("%10s", cols[i]);
}
print "";
for (i = 1; i <= 4; i++) {
printf("%-10s", rows[i]);
for (j = 2; j <= 4; j++) {
item = data[rows[i], cols[j]];
if (!item) { item = "0" };
printf("%10s", item);
}
print "";
}
}
Обратите внимание, что я явно включил все строки и столбцы из вашего примера вывода. В этом нет необходимости, если данные фактически включают все строки и столбцы, чего нет в ваших выборочных данных.
3
Michael Vehrs
27.01.2020, 21:12
Ссылка